ajouté le fait que quand le codon start est muté, on ne traite pas le cds. on cherchera un autre codon start plus tard.

réuni les cas où la différence de taille et la position sont multiple de 3, réglé des problèmes de coordonnées

annulé le changement du calcul de la position de l'insertion sur le génome target, ça cassait trop de choses et selon l'interprétation c'est cohérent

remanié le cas variation dans un codon avec différence de taille multiple de 3. simplifié, réuni des cas, code plus court et plus lisible

tests pour l'inférence des effets des variations. commencé à traiter les indel et les deletions de codons start et stop dans les cds

converti le fichier gaf avec les positions des genes dans le graphe en lignes W ajoutées au fichier gfa contenant le graphe

ajouté l'orientation des segments lors de la détection des variations, mais pas encore prise en compte