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Reunion.29.03.2023 608 B
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fadwael.khaddar_ird.fr's avatar
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####### Réunion 29.03.2023 ########


-> Calculer la profondeur moyenne des reads qui donne la méthylation
-> Donner des statitiques plus exaustives pour le contexte CHG (dans le cas de CCG, explorer cette position pour savoir si c'est bien CG est de type CpG)
-> Ajouter les informations relatives à la couverture (coverage) dans le tableau 
-> Faire la comparaison des résultats de BS-seq et EM-seq avec ceux obtenus par Nanopore. 
-> Réaliser un diagramme de Venn de ces résultats.
-> Editer le script
-> Générer les fichiers bed et les bed modifies contenant en colonne: 
        $1 $1 $8 $9 $10