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Commit 0bd151c8 authored by fadwael.khaddar_ird.fr's avatar fadwael.khaddar_ird.fr
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29.03.2023

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####### Réunion 29.03.2023 ########
-> Calculer la profondeur moyenne des reads qui donne la méthylation
-> Donner des statitiques plus exaustives pour le contexte CHG (dans le cas de CCG, explorer cette position pour savoir si c'est bien CG est de type CpG)
-> Ajouter les informations relatives à la couverture (coverage) dans le tableau
-> Faire la comparaison des résultats de BS-seq et EM-seq avec ceux obtenus par Nanopore.
-> Réaliser un diagramme de Venn de ces résultats.
-> Editer le script
-> Générer les fichiers bed et les bed modifies contenant en colonne:
$1 $1 $8 $9 $10
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