réorganisé les fonctions en deux fichiers pour plus de clareté. corrigé la gestion des délétions en fin de feature

commencé à réorganiser le code plus proprement.changé l'output du détail des variations, corrigé quelques erreurs de calculs de coordonnées

commencé à regarder si on a une insertion deletion ou substitution, et de quelle taille. pas fini, mais fonctionne

modification de l'output. on a maintenant une seule ligne par feature. une feature est transféré si sa taille total n'est pas trop eliognée de sa taille sur le genome d'origine

adapté une fonction au nouveau format du fichier qui contient les positions des segments sur les génomes

scripts python pour générer les gff du graphe et des génomes, pour l'ancienne version du graphe (minigraph), issus du jupyternotebook

script pour récupérer les coordonnées des segments sur les génomes de référence à partir d'un gfa avec walks