modifié le format du bed de sortie

seg_coord/getSegmentsCoordinates.py

@@ -72,7 +72,7 @@ for line in lines :
         else:
             orientation='.'
     
-        out_line=chr+'\t'+str(seg_start)+'\t'+str(seg_stop)+'\t'+orientation+'\t'+seg_name+'\n'
+        out_line=chr+'\t'+str(seg_start)+'\t'+str(seg_stop)+'\t'+path[i][0:1]+seg_name+'\n'
         out_bed.write(out_line)
         
         position+=segments_size[seg_name]