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TSG-QC - Installation des sources - Version Française

Prérequis

TSG-QC nécessite une version de Matlab >= R2006b La version testee la plus recente est la R2018b (Windows et Linux)

Récupération des fichiers sources

• Cloner le dépot:

  git clone https://git.outils-is.ird.fr/grelet/TSG-QC.git

ou récupérer l'archive de la dernière version sous:

https://git.outils-is.ird.fr/grelet/TSG-QC/repository/archive.zip?ref=master

• Installer la toolbox m_map (>= 1.4) sous Matlab voir: http://www2.ocgy.ubc.ca/~rich/map.html voir fichier BUGS pour version de Matlab > R2009 Avec les versions de Matlab >= R2015, installer la dernière version 1.4h de m_map, la fonction BITMAX utilisée dans m_grid.m est remplacée par FLINTMAX... Installer les fichiers de traits de cotes GSHHS sous m_map\private depuis http://www.ngdc.noaa.gov/mgg/shorelines/data/gshhs/

• Installer la toolbox seawater sous Matlab depuis le site: http://www.cmar.csiro.au/datacentre/ext_docs/seawater.htm

• Pour les versions Matlab R2006b a R2008a:

  • Installer la toolbox mexnc sous Matlab depuis: http://mexcdf.sourceforge.net/downloads/ voir lien egalement sous http://www.ird.fr/us191/spip.php?article18

  • Installer egalement la toolbox NetCDF depuis: http://mexcdf.sourceforge.net/downloads/

• Pour les versions de Matlab >= R2008b, le programme utilise le support natif des fichiers NetCDF disponible a partir de cette version. Il faut supprimer du path Matlab tout lien vers la toolbox mexnc

• Installation des fichiers de climatologie:

  Les fichiers de climatologie de surface WOA05, WOA13 ou ISAS13 sont automatiquement téléchargés par le programme à la première utilisation.

  Ils peuvent être également copiés manuellement dans un de vos répertoires Matlab accessible via matlabpath.

  Ces fichiers sont disponibles depuis:

  ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa13_annual_surf.nc ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa13_monthly_surf.nc ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa13_seasonal_surf.nc ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa05_annual_surf.nc ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa05_monthly_surf.nc ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa05_seasonal_surf.nc ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/isas13_annual_surf.nc ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/isas13_seasonal_surf.nc ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/isas13_monthly_surf.nc

  Pour la climatologie ISAS13 du LPO/IFREMER, voir la documentation sous: http://wwz.ifremer.fr/lpo/SO-Argo/Products/ISAS-T-S-fields

Ne pas oublier de modifier votre path Matlab sous Windows ou la variable MATLABPATH sous Linux afin que ces toolbox soient utilisables.

Configuration

Ajouter le chemin du repertoire de TSG-QC dans le path Matlab. Sous linux, modifier votre variable d'environnement MATLABPATH pour qu'elle pointe egalement vers TSG-QC