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TSG-QC - Installation des sources - Version Française :
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- TSG-QC nécessite une version de Matlab >= R2006b
La version testee la plus recente est la R2018b (Windows et Linux)
Récupération des fichiers sources:
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- Cloner le dépot:
$ git clone https://git.outils-is.ird.fr/grelet/TSG-QC.git
ou récupérer l'archive de la dernière version sous:
https://git.outils-is.ird.fr/grelet/TSG-QC/repository/archive.zip?ref=master
- Installer la toolbox m_map (>= 1.4) sous Matlab
voir: http://www2.ocgy.ubc.ca/~rich/map.html
voir fichier BUGS pour version de Matlab > R2009
Avec les versions de Matlab >= R2015, installer la dernière version 1.4h de
m_map, la fonction BITMAX utilisée dans m_grid.m est remplacée par FLINTMAX...
Installer les fichiers de traits de cotes GSHHS sous m_map\private
depuis http://www.ngdc.noaa.gov/mgg/shorelines/data/gshhs/
- Installer la toolbox seawater sous Matlab depuis le site:
http://www.cmar.csiro.au/datacentre/ext_docs/seawater.htm
- Pour les versions Matlab R2006b a R2008a,
+ Installer la toolbox mexnc sous Matlab depuis:
http://mexcdf.sourceforge.net/downloads/
voir lien egalement sous http://www.ird.fr/us191/spip.php?article18
+ Installer egalement la toolbox NetCDF depuis:
http://mexcdf.sourceforge.net/downloads/
- Pour les versions de Matlab >= R2008b, le programme utilise le support
natif des fichiers NetCDF disponible a partir de cette version. Il faut
supprimer du path Matlab tout lien vers la toolbox mexnc
- Installation des fichiers de climatologie:
Copier les fichiers de climato de surface WOA05, WOA13 ou ISAS13 dans
un de vos répertoires Matlab accessible via matlabpath.
Ces fichiers sont disponibles depuis:
ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa13_annual_surf.nc
ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa13_monthly_surf.nc
ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa13_seasonal_surf.nc
ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa05_annual_surf.nc
ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa05_monthly_surf.nc
ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa05_seasonal_surf.nc
ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/isas13_annual_surf.nc
ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/isas13_seasonal_surf.nc
ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/isas13_monthly_surf.nc
Pour la climatologie ISAS13 du LPO/IFREMER, voir la documentation sous:
http://wwz.ifremer.fr/lpo/SO-Argo/Products/ISAS-T-S-fields
- Ne pas oublier de modifier votre path Matlab sous Windows ou la variable
MATLABPATH sous Linux afin que ces toolbox soient utilisables.
Configuration:
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- Ajouter le chemin du repertoire de TSG-QC dans le path Matlab.
Sous linux, modifier votre variable d'environnement MATLABPATH
pour qu'elle pointe egalement vers TSG-QC