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Pipeline #66235 passed
......@@ -5,13 +5,15 @@ Les résultats sont disponible dans le répertoire **./results/** .
Ils sont organisés comme ceci :
- Racine : Les fichiers concaternés pour tout les échantillons, 1 par référence utilisées
- les consensus (FASTA)
- les statistiques de couverture (TSV)
- les lignées Nextclade et la qualité des consensus (TSV)
- les lignées Pangolin, si appelé (TSV)
- 00 - Contrôle Qualité : les fichiers de qualités sur les lectures brutes (FASTQ)
* les consensus (FASTA)
* les statistiques de couverture (TSV)
* les lignées Nextclade et la qualité des consensus (TSV)
* les lignées Pangolin, si appelé (TSV)
- 00 - Contrôle Qualité : les fichiers de qualités sur les lectures brutes (FASTQ)
* test
!!! tip
Les fichiers étiqueté comme **[TEMP]** sont supprimés par défaut, afin de préserver l'espace disque.
Si vous souhaiter les conserver, veuiller éditer le fichier de **configuration**.
......
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