Skip to content
Snippets Groups Projects
Commit 1853f9e3 authored by nicolas.fernandez_ird.fr's avatar nicolas.fernandez_ird.fr :shinto_shrine:
Browse files

Doc: update installations (en/fr)

parent 586fbd98
No related branches found
No related tags found
No related merge requests found
Pipeline #46051 passed
......@@ -13,7 +13,8 @@
![Snakemake](<https://badgen.net/badge/icon/Snakemake 8.25.3/black?icon=https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d3/Python_icon_%28black_and_white%29.svg&label&scale=0.9>)
![Conda](<https://badgen.net/badge/icon/Conda 24.11.0/black?icon=codacy&label&scale=0.9>)
# GeVarLi: **Ge**nome assembly, **Var**iant calling and **Li**neage assignation
# **GeVarLi**
# **Ge**nome assembly, **Var**iant calling and **Li**neage assignation
## About
......
......@@ -13,10 +13,11 @@
![Snakemake](<https://badgen.net/badge/icon/Snakemake 8.16.0/black?icon=https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d3/Python_icon_%28black_and_white%29.svg&label&scale=0.9>)
![Conda](<https://badgen.net/badge/icon/Conda 24.7.1/black?icon=codacy&label&scale=0.9>)
# GeVarLi #
# GeVarLi
## Assemblage de GEnomes, Détection de VARiants et Assignation de LIgnées
# Assemblage de **ge**nomes, Détection de **var**iants et Assignation de **li**gnées
## A propos
GeVarLi est un pipeline Snakemake FAIR, open-source, évolutif, modulable et traçable. Il est utilisé pour l’assemblage de génomes et le suivi des variants du SARS-CoV-2 (et d’autres virus), en exploitant les séquences de lectures courtes générées par les bibliothèques COVIDSeq&trade; d’Illumina Inc.
GeVarLi a été initialement développé en interne (octobre 2021) pour le projet **[AFROSCREEN](https://www.afroscreen.org/)**, avant d’être rendu public sur GitLab (mars 2022).
......
0% Loading or .
You are about to add 0 people to the discussion. Proceed with caution.
Finish editing this message first!
Please register or to comment