deleted functions not used

Functions.py

@@ -485,95 +485,3 @@ def invert_segment_list(seg_list):
         list_inverted.append(inv_seg)
     return list(reversed(list_inverted))
         
-
-
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-# pour faire l'inférence, lire le fichier variations.txt et l'interpréter. pour chaque variation, regarder ce que ça fait.
-# donc première étape quand on appelle la fct "inférence", c'est d'ajouter dans les features leur séquence avec seg_seq et la liste des segments.
-
-def add_feature_sequence(feature,seg_seq):
-    feature_sequence=""
-    for segment in feature.segments_list:
-        if segment==feature.segments_list[0]:
-            feature_sequence+=get_segment_sequence(seg_seq,segment)[feature.pos_start-1:] # revérifier les +/- 1 pour la position, avec de vraies données
-        elif segment==feature.segments_list[-1]:
-            feature_sequence+=get_segment_sequence(seg_seq,segment)[0:feature.pos_stop] # revérifier les +/- 1 pour la position, avec de vraies données
-        else:
-            feature_sequence+=get_segment_sequence(seg_seq,segment)
-    feature.sequence=feature_sequence
-
-def transcription(dna_sequence):
-    rna_sequence=""
-    for dna_base in dna_sequence:
-        match dna_base:
-            case "A":
-                rna_sequence+="U"
-            case "C":
-                rna_sequence+="G"
-            case "G":
-                rna_sequence+="C"
-            case "T":
-                rna_sequence+="A"
-    return rna_sequence 
-
-# penser à transcrire la séquence codante du gène !!
-def get_aa(codon):
-    match codon[0:2]:
-        case "UU":
-            if (codon[2]=="U") | (codon[2]=="C"):
-                return "Phe"
-            else:
-                return "Leu"
-        case "UC":
-            return "Ser"
-        case "UA":
-            if (codon[2]=="U") | (codon[2]=="C"):
-                return "Tyr"
-            else:
-                return "Stop"
-        case "UG":
-            if (codon[2]=="U") | (codon[2]=="C"):
-                return "Cys"
-            elif codon[2]=="A":
-                return "Stop"
-            else:
-                return "Trp"
-        case "CU":
-            return "Leu"
-        case "CC":
-            return "Pro"
-        case "CA":
-            if (codon[2]=="U") | (codon[2]=="C"):
-                return "His"
-            else:
-                return "Gln"
-        case "CG":
-            return "Arg"
-        case "AU":
-            if codon[2]=="G":
-                return "Met"
-            else:
-                return "Ile"
-        case "AC":
-            return "Thr"
-        case "AA":
-            if (codon[2]=="U") | (codon[2]=="C"):
-                return "Asn"
-            else:
-                return "Lys"
-        case "AG":
-            if (codon[2]=="U") | (codon[2]=="C"):
-                return "Ser"
-            else:
-                return "Arg"
-        case "GU":
-            return "Val"
-        case "GC":
-            return "Ala"
-        case "GA":
-            if (codon[2]=="U") | (codon[2]=="C"):
-                return "Asp"
-            else:
-                return "Glu"
-        case "GG":
-            return "Gly"
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