filetree.rst.txt

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    ├── dl_S2.csv
    ├── __init__.py
    ├── parameters
    │   ├── __init__.py
    │   ├── csv_files
    │   │   └── params_samir_test.csv
    │   └── params_samir_class.py
    ├── DEV_inputs_test
    │   ├── soil_100.nc
    │   ├── ndvi_100.nc
    │   ├── soil_1000.nc
    │   ├── ndvi_10.nc
    │   ├── xls_NDVI_10.nc
    │   ├── xls_NDVI_100.nc
    │   ├── soil_10.nc
    │   ├── ndvi_1000.nc
    │   ├── land_cover_100.nc
    │   ├── xls_weather_10.nc
    │   ├── pix_outputs_10.nc
    │   ├── land_cover_10.nc
    │   ├── xls_outputs_100.nc
    │   ├── xls_outputs_10.nc
    │   ├── xls_weather_1000.nc
    │   ├── xls_weather_100.nc
    │   ├── land_cover_1000.nc
    │   └── xls_NDVI_1000.nc
    ├── test_samir_dask.py
    ├── tests.py
    ├── modspa_pixel_env.yml
    ├── source
    │   ├── code_toolbox.py
    │   └── modspa_samir.py
    ├── SAMIR_xls
    │   ├── SAMIRv5_juin2015.xlsx
    │   └── SAMIRpixel_Reference_Simonneaux2012.xls
    ├── test_S2_one_tile.csv
    ├── config
    │   ├── config.py
    │   └── config_modspa.json
    ├── dev_samir_xarray.ipynb
    ├── preprocessing
    │   ├── download_S2.py
    │   ├── parcel_to_pixel.py
    │   ├── lib_era5_land_pixel.py
    │   ├── calculate_ndvi.py
    │   ├── input_toolbox.py
    │   └── download_ERA5_weather.py
    ├── test_samir.py
    ├── README.md
    ├── postprocessing
    └── docs
        ├── source
        │   ├── inputs
        │   │   ├── samir_params.rst
        │   │   ├── weather_cube.rst
        │   │   ├── land_cover.rst
        │   │   ├── ndvi_cube.rst
        │   │   ├── input_preparation.rst
        │   │   └── soil_data.rst
        │   ├── conf.py
        │   ├── file_structure.rst
        │   ├── .templates
        │   ├── filetree.rst
        │   ├── samir
        │   │   ├── data_and_ram_management.rst
        │   │   ├── samir_functions.rst
        │   │   └── run_samir.rst
        │   ├── index.rst
        │   ├── .static
        │   └── setup
        │       ├── json_config_file.rst
        │       ├── conda_env.rst
        │       └── setup.rst
        ├── build
        └── Makefile

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