# TSG-QC - Installation des sources - Version Française

## Prérequis

 TSG-QC nécessite une version de Matlab >= R2006b
    La version testee la plus recente est la R2018b (Windows et Linux)

## Récupération  des fichiers sources

* Cloner le dépot:

    > git clone <https://git.outils-is.ird.fr/grelet/TSG-QC.git>

ou récupérer l'archive de la dernière version sous:

<https://git.outils-is.ird.fr/grelet/TSG-QC/repository/archive.zip?ref=master>

* Installer la toolbox m_map (>= 1.4) sous Matlab
    voir: <http://www2.ocgy.ubc.ca/~rich/map.html>
    voir fichier BUGS pour version de Matlab > R2009
    Avec les versions de Matlab >= R2015, installer la dernière version 1.4h de
    m_map, la fonction BITMAX utilisée dans m_grid.m est remplacée par FLINTMAX...
    Installer les fichiers de traits de cotes GSHHS sous m_map\private
    depuis <http://www.ngdc.noaa.gov/mgg/shorelines/data/gshhs/>

* Installer la toolbox seawater sous Matlab depuis le site:
    <http://www.cmar.csiro.au/datacentre/ext_docs/seawater.htm>

* Pour les versions Matlab R2006b a R2008a:
  * Installer la toolbox mexnc sous Matlab depuis:
      <http://mexcdf.sourceforge.net/downloads/>
      voir lien egalement sous <http://www.ird.fr/us191/spip.php?article18>
  
  * Installer egalement la toolbox NetCDF depuis:
      <http://mexcdf.sourceforge.net/downloads/>

* Pour les versions de Matlab >= R2008b, le programme utilise le support natif des fichiers NetCDF disponible a partir de cette version. Il faut supprimer du path Matlab tout lien vers la toolbox mexnc

* Installation des fichiers de climatologie:

    Les fichiers de climatologie de surface WOA05, WOA13 ou ISAS13 sont automatiquement téléchargés par le programme à la première utilisation.

    Ils peuvent être également copiés manuellement dans
    un de vos répertoires Matlab accessible via matlabpath.

    Ces fichiers sont disponibles depuis:

  <ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa13_annual_surf.nc>
  <ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa13_monthly_surf.nc>
  <ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa13_seasonal_surf.nc>
  <ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa05_annual_surf.nc>
  <ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa05_monthly_surf.nc>
  <ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/woa05_seasonal_surf.nc>
  <ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/isas13_annual_surf.nc>
  <ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/isas13_seasonal_surf.nc>
  <ftp://ftp.ifremer.fr/ifremer/ird/us191/oceano/lib/matlab/isas13_monthly_surf.nc>

  Pour la climatologie ISAS13 du LPO/IFREMER, voir la documentation sous:
  <http://wwz.ifremer.fr/lpo/SO-Argo/Products/ISAS-T-S-fields>

Ne pas oublier de modifier votre path Matlab sous Windows ou la variable MATLABPATH sous Linux afin que ces toolbox soient utilisables.

## Configuration

Ajouter le chemin du repertoire de TSG-QC dans le path Matlab.
    Sous linux, modifier votre variable d'environnement MATLABPATH
    pour qu'elle pointe egalement vers TSG-QC